1918 -1925 гг. Работа Комиссии по охране памятников искусства и старины Троице-Сергиевой лавры. Задачи комиссии - прием, учет, изучение и определение художественной ценности сокровищ лавры; - изучение, регистрация и охрана памятников культуры в городе и прилегающем к нему районе; - организация реставрации памятников живописи, шитья, архитектуры.
20 апреля 1920 года – Декрет СНК «Об обращении в музей историко-художественных ценностей Троице-Сергиевой лавры».
1920 – 1929 гг. – Сергиевский историко-художественный музей находился в ведении Наркомпроса РСФСР (управление Главнауки, отдел по делам музеев и охраны памятников) Экспозиция представляла комплекс выставок. Музей складывался из следующих разделов: I. Древлехранище. II. Историко-художественного отдел с выставками: 1. Прикладного искусства XIV-XV вв. 2. Древнерусской книги 3. Древнерусской живописи с показательной иконописной мастерской 4. Шитья и тканей 5. Иконографии Троице-Сергиевой лавры 6. Архитектуры (архитектурный ансамбль) 7. Соборов Троицкого и Успенского III. Отдела историко-бытового с показом: 1. Чертогов (царский быт) 2. Митрополичьих покоев (быт высшего духовенства) 3. Филиала в Вифании (покои митрополита Филарета и церковь Преображения) 4. Филиала в Гефсимании (покои митрополита Филарета и церковь из с. Подсосенья XVII в.)
1929 г. – Реорганизация музея. Преобразование в Сергиевский (с 1930 г. – Загорский) государственный историко-художественный, бытовой и антирелигиозный музей. Закрыты филиалы в Гефсимании и Вифанском скиту. Открыты историко-революционный и антирелигиозный отделы. В связи с реорганизацией из музея был изъят и передан другим музеям ряд уникальных произведений из бывшего лаврского собрания.
1929 – 1939 гг. – в ведении обл. МОНО (музейный п/отдел) и Управления по делам искусств при МОСОБЛИСПОЛКОМЕ. 1930 г. В состав музея влились коллекции Музея Сергиевского края, представлявшие собой работы местных мастеров игрушки, резьбы по дереву, лаковой росписи и положившие начало складыванию в музее коллекций русского народного искусства и народных художественных промыслов.
1930 г. В музей поступило большое частное собрание профессора А.А. Александрова, включавшее в себя произведения живописи, графики, фарфора, и стекла XVII – XIX вв. 1939 г. Учрежден Ученый Совет музея.
1939 г. Утвержден Генеральный план реставрационных работ до1943 г. со сметой в 6 млн.руб.
1940 г. Постановлением Совета Народных Комиссаров РСФСР весь комплекс Загорского музея объявлен заповедником. Одновременно восстановлен статус историко-художественного.
1940 – 1949 гг. – Музей находится в ведении Управления по делам искусств при СНК РСФСР (с 1946 г. – Комитет по делам искусств при Совете Министров РСФСР).
1941 г. Распоряжением СНК РСФСР в Загорский историко-художественный музей-заповедник были переданы коллекции Музея народных художественных ремёсел, представлявших собой богатое собрание произведений народного искусства и художественных промыслов Российской Федерации.
К 1941 году окончательно определился профиль коллекций музея, представляющих - историю Троице-Сергиева монастыря; -древнерусское искусство XIV-XVII вв.; - искусство XVIII - начала XX вв. во всем его многообразии; - народное искусство XVIII - начала XX вв. - народные художественные промыслы и прикладное искусство ХХ в.
С 1946 по 1949 год на основании ряда Постановлений Совета Министров СССР музей передал в пользование Московской Патриархии все культовые здания(кроме церкви свв. Зосимы и Савватия), большую часть гражданских и крепостных сооружений, а также значительное число икон, богослужебных книг и тканей.
1949 – 1954 гг. – Музей находится в ведении Комитета по делам искусств при Совете Министров СССР.
1954 – 1956 гг. – Музей находится в ведении Управления музеев Министерства культуры РСФСР.
С 1956 г. – Музей передан в ведение Московского областного Управления культуры (ныне Министерство культуры Московской обл.).
С 1950-х годов музеем была развёрнута широкая собирательская работа по комплектованию и развитию коллекций в сложившемся к этому времени профиле. 1958 г. Начало издания «Сообщений Загорского музея».
Возобновление активной издательской деятельности 1963 г. В.И. Балдиным и А.Г. Устиновым разработан комплексный проект по реставрации Троице-Сергиевой лавры.
1969 г. – Загорский музей включен во Всесоюзный туристический маршрут «Золотое кольцо России.»
1969 г. – Конференция, посвященная 100-летию В.И. Ленина. Обобщен опыт работы 1950-1960-х гг. во всех видах музейной деятельности.
Начало 1970-х гг. На площади 4 600 кв.м. была развернута система экспозиций: «История Троице-Сергиевой лавры», «Некрополь Троице-Сергиевой лавры», «Архитектурный ансамбль Троице-Сергиевой лавры и методы его реставрации», «Древнерусская живопись XIV-XVII вв.», «Древнерусское прикладное искусство XIV-XVII вв.», «Русское искусство XVIII- начала ХХ вв.», «Русское народное искусство XVIII- начала ХХ вв.», «Современное декоративно-прикладное искусство».
С 1980-х годов активно формируются коллекции археологическая, краеведческая и изобразительного искусства художников Сергиева Посада, представленных до этого времени лишь отдельными группами произведений.
1990 г. – Возобновление сборников «Сообщений Сергиево-Посадского музея».
1991 г. – Сотрудниками музея подготовлен пакет научно-технической документации о включении архитектурного ансамбля Троице-Сергиевой лавры в Почетный список культурного наследия ЮНЕСКО.
1992 г. – Распоряжением Президента РФ и Председателя Верховного Совета РФ № 584-рп от 15.10.1992 г. музей отнесён к особо ценным объектам национального культурного наследия Российской Федерации. Распоряжение предусматривало и поэтапный вывод музея с территории Троице-Сергиевой лавры. Этот вывод осуществлялся в течение 2000 – 2003 гг. Музейные коллекции разместились в помещениях : Ризницы (на территории ТСЛ) – «Ризница Троице-Сергиевой лавры XIV-XIХ вв»; историко-архитектурного комплекса «Конный двор» - экспозиции: «Древнейшее прошлое Сергиево-Посадского края», «Троице-Сергиева лавра: архитектурный ансамбль, страницы истории», «Декоративно-прикладное искусство XVIII- ХХ вв. (открытые фонды)»; Главного корпуса музея (пр.Красной Армии, д. 144) – выставки современных художников; здания по Овражному пер. д. 9а – комплекс выставок по истории и культуре Сергиево-Посадского края ХХ в.
1993 г. Архитектурный ансамбль Троице-Сергиевой лавры включен в Почетный список культурного наследия ЮНЕСКО.
1997 г. – Международная конференция «Каменный век европейских равнин» С 1998 г. (каждые два года) проводится Международная конференция «Троице-Сергиева лавра в истории, культуре и духовной жизни России»
С 1998 г. - каждые два года по настоящее время проводится Международная конференция «Троице-Сергиева лавра в истории, культуре и духовной жизни России».
2002 г. - Выставочный и издательский проект "Троице-Сергиева Лавра и русские государи:реликвии и художественные сокровища".
2005 г. - Юбилейные мероприятия по празднованию 85-летия музея.
2007 г. – на базе Музея Министерством культуры Московской области проведен семинар по вопросам сохранения традиций народных художественных промыслов.
2008 г. – создана экспозиция "Мир русской деревни". Богатейшая коллекция художественных промыслов представлена методом экспонирования «открытых фондов».
2009 г. – Музей начал проведение Международного Фестиваля «Славянский путь», в котором приняли участие наши коллеги из Болгарии, Польши, Сербии.
2010 г. - празднование 90-летия музея. Вышла в свет книга «Сергиев Посад. Взгляд сквозь века» (Сергиев Посад, издательство «Ремарко»).
2014 г. – Музей торжественно отметил 700-летие преподобного Сергия Радонежского. Была создана выставка «И свеча не угасла..», которая впервые объединила произведения XV – начала XXI в., посвященные Св. Сергию.
2015 г. – в дни юбилейных торжеств, посвященных 95-летию Сергиево-Посадского музея-заповедника и 70-летию Победы в Великой Отечественной войне, были проведены большие праздники с конкурсами, концертными и интерактивными программами.
2017 г. – в музее прошла выставка "Пафос и символы эпохи", посвящённая 100-летию Октябрьской революции.
2008-2018 гг. – просветительская служба музея ввела в практику своей работы много новых, современных мероприятий: интерактивные программы на выставках, игры-квест, кинолектории, музыкальные и литературные вечера, флеш-мобы на открытом воздухе во время массовых празднований, интеллектуальные гостиные и др.
2019 г. – в помещениях Ризничного корпуса завершились ремонтно-реставрационные работы, начатые в 2014 г., и открылась новая экспозиция – «Реликвии и сокровища Троице-Сергиева монастыря XI-XVII веков».